Abstract
摘要:臺灣大學生農學院獸醫學系組織切片影像數位化實驗室
臺灣大學為了提昇生物醫學教學與研究的品質及促進國際性合作交流,與張詠惠小姐教務處、生農學院及獸醫學系(以下簡稱本系)共同支援新購置之全世界最先進的高品質「組織切片影像數位化系統」(Digital Pathology System)貴重儀器(相關儀器經費約為448萬元整),並成立「組織切片影像數位化實驗室」。萬灼華老師與張詠惠小姐由美嘉儀器公司陳永銘先生指導如何操作組織切片掃描及數位影像檔案管理(教育訓練80小時)。萬老師與張小姐於96年8月完成架設「實驗動物組織病理監測實習」課程網路平台,並提供全臺灣第一個數位化動物病理切片網路教學平台。教育部顧問室審核委員們、獸醫界前輩們及修課學員們對此國際等級組織切片影像數位化系統與教學設備讚賞有加。「組織切片影像數位化實驗室」已於96年11月底,啟動線上服務http://www.vm.ntu.edu.tw/dplab/,並於97年1月納入研發會的全校性虛擬貴重儀器中心網站,提供臺大所有院區(包括校總區、醫學院、附設醫院等研究單位) 組織切片影像數位化資料平台的連線服務。
為增進本設備之發展及使用效益,提供校內外教學及研究所需之組織切片影像數位化的服務,加速提升教學與研究品質,經96學年度第1次獸醫學系(所)務會議通過國立臺灣大學生物資源暨農學院獸醫學系組織切片影像數位化實驗室之服務管理辦法,並成立「臺灣大學生農學院獸醫學系組織切片影像數位化實驗室」(以下簡稱本實驗室)。此「組織切片影像數位化系統」乃歸屬於臺灣大學跨院系虛擬貴重儀器中心,目前設置在本系三館四樓411室的「臺灣大學生農學院獸醫學系組織切片影像數位化實驗室」,將提供全校所有院區的教學與研究人員最即時、完善且便利的服務,使教學與研究品質提昇,以達到國際水準,為提昇本校邁向頂尖大學的目標跨進一大步。
「組織切片影像數位化系統」的研究應用領域相當廣泛,此系統將有助於所有細胞組織相關的教學與研究(包括所有的動植物組織學、病理學、毒理學、組織微陣列、遠端病理學、微生物與細胞抹片分析、影像分析等)。由於此設備極貴重且操作繁瑣,需由受過操作教育訓練之技術人員提供組織影像數位化服務及網路平台的管理。本實驗室目前由本系萬灼華老師負責管理,將由張詠惠小姐提供「組織切片影像數位化」專業技術服務。至目前為止,本實驗室已對校內研究單位開始提供切片影像數位化服務,包括獸醫學系病理組的劉振軒主任、鄭謙仁老師及萬灼華老師、朱瑞民老師及動物癌症研究中心等研究單位。另外,臺大牙醫學系與外界研究機構如台北病理中心亦已與本實驗室商討未來合作的可能性。希望藉由萬灼華老師的管理與張詠惠小姐的專業研究技術服務,本實驗室能使此「組織切片影像數位化系統」貴重儀器設備的功能發揮到極限,以便提供全校持續性國際化水準的服務品質,有助提高臺大教學研究品質及國際競爭力,可使臺大生物醫學研究與教學向國際化邁進一大步。
本計畫第一年的目標針對臺大及國內各個生物醫學研究單位及產業界提供動植物組織切片影像數位化及組織病理切片影像數位化的服務與相關資料,以促進國內學術與研究單位之交流。第二年的目標為藉此完整的數位化動物組織及獸醫病理切片教材資料庫,利用視訊設備,與國際著名研究單位進行同步遠距研究與病例討論。不但有助於國際間學術交流,相關設備亦可供研究之用,使研究潛能發展無限,並為提昇本校邁向頂尖大學目標跨進一大步。
「臺灣大學生農學院獸醫學系組織切片影像數位化實驗室」之研究計畫共有五大工作項目,如下:
(一)工作項目一:提供「組織切片影像數位化系統」服務,成為臺大全校性高水準品質服務的設備
目前台大仍使用傳統式的教學設備(傳統式光學顯微鏡及組織切片等),由於有些病理教學教材不易取得或不易保存且設備的不足,使得研究與教學品質不易提昇,甚至可能無法維持臺灣大學之ㄧ流大學的水準。專業技術人員將利用此貴重儀器提供數位化服務,將研究或教學用之組織病理切片數位化,此服務將有助於教授及研究人員保存研究資料,以提昇教學品質及有利於國際合作。至目前為止,申請人已開始為校內數位教授提供切片數位化服務,包括獸醫學系病理組的劉振軒主任、鄭謙仁老師及萬灼華老師、朱瑞民老師及動物癌症研究中心等研究單位。另外,臺大牙醫學系與外界研究機構如台北病理中心亦已與本實驗室商討未來合作並應用於教學的可能性。
本貴儀實驗室在短短兩個月內即有此等服務成果,相信未來經由宣傳使服務範圍擴大,更可有效應用於教學與研究改進,將有助於臺大更進一步邁向頂尖大學。
(二)工作項目二:維護網站運作即時提供數位化服務
本實驗室在今年獸醫病理課程中,利用網路平台提供無時間及空間限制之數位化組織病理網路平台。於96年11月底,組織切片影像數位化實驗室已啟動:網址http://www.vm.ntu.edu.tw/dplab/,並於97年1月納入全校性虛擬貴重儀器中心,提供本校所有院區(包括校總區、醫學院、附設醫院等研究單位),即時網路連線至本資料儲存平台,提供全校所有教學與研究人員進行數位化組織病理網路平台,使教學與研究同步進行,達到國際水準。
(三)工作項目三:推廣組織病理國際化教學
促進與協助組織病理相關課程教學國際化為本實驗室技術人員張詠惠小姐工作項目之ㄧ,張小姐已於今年暑期參與國際合作教學提昇教學品質計畫,與美國密蘇里大學實驗動物診斷實驗室Research Animal Diagnostic Laboratory(RADIL)進行國際性合作交流,利用此新購建之設施系統與網路平台,成功完成第一次臺大獸醫學系實驗動物病理的國際合作教學計劃。於此次成功案例中,由RADIL提供實驗動物病理教學切片,經由組織切片數位化後,藉由網路平台使台灣學生於網站即可學習到國際的典型病例,而同時在美國RADIL住院醫師也可利用此系統進入數位化的網路平台學習。雙方皆對此次合作模式成果相當滿意,並討論未來進一步合作的可能性。藉由此次國際教學合作個案經驗,未來臺大可經由網路與數位化組織教學系統,本校各單位可利用此國際等級設備,與國外著名研究教學單位進行同步遠距教學與病例討論,協助推廣組織病理國際化教學,將有助提昇本校邁向頂尖大學目標。
(四)工作項目四: 促進國際間學術研究的合作交流
張詠惠小姐的另一工作項目為協助遠距研究或會議進行,提供網路平台與數位化服務。臺大獸醫系於96年8月底主辦「第三屆亞洲獸醫病理聯盟會議」時,利用本組織切片數位化與網路平台服務,使病理會議以國際等級水準進行,成果廣受極佳好評。許多亞洲獸醫病理聯盟會員與專家們於會後表示盼未來有機會能再度利用此切片掃描系統,持續擴大國際病例合作的機會,以促進行臺大與國際間學術研究的合作交流,亦能使臺大邁向國際化。
(五)工作項目五: 自己自足永續服務
協助本實驗室主持人的主要職務為爭取營運經費來維持實驗室的正常運
作。透過此位工作人員製作一套介紹本實驗室的功能與服務項目的宣傳品,於國內與國際性會議或研討會廣為推銷宣傳,來爭取校內、外與產業界顧客,以增加營運收入,來確定本實驗室在成立3年後能自己自足持續營運。
Abstract: Digital Pathology Laboratory
Digital Pathology Laboratory (DPLab) is a lab providing services to digitize histology and pathology slides. We provide systems and services for digital pathology, a digital environment for the management and interpretation of histology and pathology information that originates with the digitization of a glass slide.
DPLab purchases the ScanScope® CS slide scanning systems and Spectrum™ digital pathology information management software with support fundings (4,480,000 dollars) obtained from the Dept of Veterinary Medicine, the NTU Office of Academic Affairs, and the College of Bioresources and Agriculture. This digital image system will improve the efficiency and quality on zoology, botany, microorganism, pathology, toxicology, and other professionals. The ScanScope® slide scanner creates a digital image of an entire microscope slide at giga-pixel resolution in minutes, with inherently superior image quality. The Spectrum software provides a consolidated view of relevant case information anywhere, anytime and with clinical and workflow tools to improve the quality and efficiency of pathology services. DPLab will make glass slide archival images by the ScanScope® CS slide scanner and the Spectrum software for professors and researchers in NTU.
DPLab has set up and provided online services since Nov. 2007. The DPLab website is: http://www.vm.ntu.edu.tw/dplab/. Our laboratory provides online services at anytime and anywhere to NTU professors and students for using digital pathology data in study, research, and education. The digital slide imaging services will also advance the quality of instruction and analysis for biological medicine, and promote the cooperation between international and National Taiwan University.
Five important services will be the goals for the DRLab in this year:
1st service: Providing slide scanning services to digitize histology/pathology slides.
2nd service: Managing online platform in service; providing digital pathology images online for use in anytime and anywhere.
3rd service: Introducing the Digital Pathology System and online teaching/study system to professors and researchers in Taiwan.
4th service: Promoting the cooperation between international institutions and NTU in both research and academic teaching.
5th service: Through the great services, making sufficient income to support the Digital Pathology Laboratory for continual services in NTU.
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