培養過程中提升藍綠菌相對豐度的處理方法
Other Title
Identifying treatments that increase the relative abundance of cyanobacteria during enrichment
Journal
2024臺大學士論文獎
Date Issued
2024
Author(s)
Yu Ting Huang
Advisor
Abstract
藍綠菌和植物及藻類相同，能利用可見光 (波長 :400-700nm)行光合作用，但有一部分特殊的藍綠菌除了能夠利用可見光之外也能利用能量更低的遠紅光 (波長 : 700-800 nm)行光合作用。純化這些藍綠菌可以使用遠紅光培養，但藍綠菌在低能量的遠紅光下生長緩慢，因此加速純化過程對後續的研究至關重要。
本研究利用16S rDNA定序了解不同處理下的菌相變化，計算相對豐度，若能增加樣本中藍綠菌相對豐度，則能使藍綠菌菌落在固體培養基上的數量上升，提高後續純化成功的機率，加速純化過程。因此，我於實驗中測試以不同條件培養環境樣本，分析何種處理能夠使藍綠菌數量增加。首先使用藍綠菌模式菌株Synechocystis sp. PCC 6803 (Syn 6803)與可利用遠紅光的藍綠菌株Chlorogloeopsis fritschii PCC 9212 (Cf 9212)進行抗生素濃度及培養液pH值培養條件測試，參考培養條件測試結果設定後續實驗的抗生素濃度及培養液pH值。後續實驗包含抗生素處理 Imipenem 5、50μg/ml及 Novobiocin 10 μg/ml、pH10處理、培養液濃度稀釋2倍及4倍。最後使用16S rDNA V3-V4片段定序分析菌相組成，分析結果後發現使用抗生素 Novobiocin 10 μg/ml處理後整體藍綠菌相對豐度增加最多且對遠紅光藍綠菌菌相組成影響最小，對藍綠菌及遠紅光藍綠菌以外的細菌如: Acidobacteria、Actinobacteria、Chloroflexi及Planctomycetota相對豐度有降低的效果，在提高遠紅光藍綠菌相對豐度的同時抑制其他細菌的相對豐度。
此結果可以為未來遠紅光藍綠菌純化方法提供更多元的參考。此外，實驗分析包含所有藍綠菌，對於一般藍綠菌的純化工作也有幫助。
Subjects
藍綠菌
遠紅光藍綠菌
Novobiocin
Publisher
國立臺灣大學生命科學系
Description
指導教授：何銘洋
Type
thesis
File(s)![Thumbnail Image]()
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Name
生命科學系_黃榆婷(已保全).pdf
Size
2.64 MB
Format
Adobe PDF
Checksum
(MD5):65f3b65fa7e02483b7273885e178267b