國立台灣大學醫學院 (以下簡稱本院) 為提昇醫療保健之藥物研究水準，推動產學交流，依本校組織規程第八條第三項規定，特設立「藥物研究中心」(以下簡稱本中心)。

本中心的任務為整合本院藥物研發團隊，執行本院醫療保健有關之藥物研究開發，推動與執行製藥工業相關之產學合作，協助產業界藥物研發工作及人才培訓，並執行院方交辦之事項。中心平日之業務為學界之建教合作(含成分分析/鑑定/藥效/毒理/臨床研究)、藥物之品質檢控、中藥炮製前後與保育藥材替代物之成分/藥效/毒理研究等。

為執行上述任務，本中心置主任一名，由醫學院院長就相關領域教授中推薦並提請校長聘兼之，任期三年，連任以一次為原則，綜理本中心業務。除主任之外中心下設八個功能小組：「藥物探索研究組」、「藥物分析組」、「製程開發組」、「藥劑研究組」、「藥物動力學組」、「藥效及毒理評估組」、「藥物資訊組」、「產學推動組」，分別由醫學院相關教師兼任之(更新中)。

除此之外，本中心另設有諮詢委員會，均由醫學院院長提請校長聘兼之，委員分別為，(基礎醫學)符文美教授、鄧哲明教授、陳桂恆教授，(臨床醫學) 楊志新教授，(產業界) 程正禹 (台耀化學)、高純琇(財團法人醫藥品查驗中心)、陳正 (健亞生物科技)。

本中心應業務需要，得置專兼任研究員、副研究員、助理研究員、職員各若干名，所需員額由醫學院員額調配。此外，本中心每學期至少召開中心業務會議一次，由中心主任、各組組長、研究員、職員代表組織之，討論中心有關業務事項。