陳炳煇臺灣大學：機械工程學研究所簡黃輕Jian, Huang-CingHuang-CingJian2007-11-282018-06-282007-11-282018-06-282006http://ntur.lib.ntu.edu.tw//handle/246246/61586本研究首先介紹並且根據 Real-Time PCR 光學檢測系統的架構和需求，以 CMOS 製程技術為基礎去設計和選取適當的光柵製程參數與形狀，利用半導體製成方式製作 CMOS 光柵並且加以後製程，其光柵面積為 2 mm × 2 mm ，接著利用光學擬真模擬光路軟體 TracePro 來模擬光學實驗裝置的配置相對位置，並且量測 DNA 樣本試劑激發螢光之光譜，最後和商用光柵之實驗結果互相做比較，以探討 CMOS 製程光柵的性能和效益。 實驗結果顯示，本研究利用半導體製程成功開發出專用於 Real-Time PCR 光學檢測系統的光柵， CMOS 光柵能量測到 DNA 樣本試劑的所激發螢光訊號，而其光柵的面積較一般市售光柵可減少其光柵面積 80 % ，並且降低光柵製作 21 % 的成本。在 Real-Time PCR 分光系統光柵的設計，本論文提供了另一個製程的方向和參數，以作為將來改良的參考。First, according to the structure and need of the optics examination system in Real-Time PCR and the CMOS manufacturing process technique, this study go to develop the parameter and shape of grating. The size of CMOS grating designed is 2 mm × 2 mm. Second, the simulation imitates the light road of optics experiment equip by light tracing imitating software TracePro. Third, the experiments measure the fluorescence spectrum of the DNA sample. Finally, in order to inquire into the function and the benefit of the CMOS grating, the results compare the experiment of the CMOS grating with the commercial grating. Test the result manifestation, the CMOS grating can measures the fluorescence of DNA sample and this research makes use of the CMOS grating that to be used particularly for the Real-Time PCR optics examination system successfully. Besides, the area of CMOS grating can reduce 80% comparing with the commercial grating and the cost of CMOS grating can reduce 21% comparing with commercial. To design the optics examination system in Real-Time PCR, this thesis provided another direction of manufacturing process and parameter to is the reference that the future improves.誌謝 中文摘要 I Abstract II 符號說明 III 目錄 IV 附圖目錄 VII 附表目錄 X 第一章　序論 1 1.1　研究背景 1 1.2　研究目的 3 1.3　文獻回顧 4 1.4　研究方法 6 第二章　光學檢測系統與光柵原理 8 2.1　光學檢測系統架構 8 2.1.1　離散式螢光波段光學檢測系統設計 8 2.1.2　連續式螢光波段光學檢測系統設計 9 2.2　光柵的分類和基本原理 10 2.2.1　光柵的種類 10 2.2.2　反射式光柵的工作原理與製作 11 2.2.3　光柵的效能 13 第三章　CMOS製程光柵的設計與製作 19 3.1　COMS 製程光柵設計和基本架構 19 3.2　COMS 製程光柵後製程流程 22 第四章　TracePro 光路模擬 34 4.1　光學軟體 TracePro 34 4.2　光學軟體 TracePro 模擬 35 4.2.1　模擬前處理 35 4.2.2　模擬計算 37 4.2.3　模擬後處理 37 第五章　研究設備與實驗步驟 43 5.1　實驗設備 43 5.1.1　入射光源和鏡組的選取 43 5.1.2　感光耦合元件陣列 45 5.1.3　商用光柵 45 5.2　實驗步驟 46 5.2.1　光柵實驗架構及步驟 46 5.3　訊號處理 47 5.4　樣本試劑被激發螢光之量測 50 5.4.1　實驗裝置 50 5.4.2　實驗步驟 52 第六章　實驗結果與分析 65 6.1　CMOS 光柵性能量測實驗結果與分析 65 6.1.1　分光光譜之強度比較 66 6.1.2　分光光譜之重疊性 ( overlap ) 比較 66 6.1.3　分光光譜之鑑別度比較 67 6.2　樣本試劑激發螢光量測結果分析與討論 68 第七章　結論與分析 86 參考文獻 896759278 bytesapplication/pdfen-USDNA樣本試劑螢光量測CMOS基因定量分析光柵gratingREAL-TIME PCRthesishttp://ntur.lib.ntu.edu.tw/bitstream/246246/61586/1/ntu-95-R93522306-1.pdf