2009-10-012024-05-14https://scholars.lib.ntu.edu.tw/handle/123456789/656250摘要：過去十年來，針對人體與其他動物腸胃道微生物的研究逐漸熱門，主要是因為分子 遺傳工具的進展，得以揭露出腸胃道微生物的多樣性。微生物學家、生態學家與演化 學家都對腸胃道微生物研究相當熱中，想要探究何以在狹小的消化道生態系統內會出 現多樣性如此高的腸胃道微生物相。再者，微生物與其寄主如何演化出互利共生的關 係。腸胃道微生物相的研究可以回答許多重要的問題。在醫學研究上，可以探討腸胃 道微生物相之動態對人體（寄主）健康的影響。在生態學上，則可以探討大量微生物 物種共存的機制。而就演化的角度來看，微生物與其寄主是否有共同演化，也是一大 課題。三個不同的角度彼此互相影響並得利於彼此研究思維與進展。我們尤其希望從 生態演化的角度去探討此豐富的微生物生態系統。 雖然在腸胃道微生物相的研究上已投入大量工作，但所得到的資料多半未與生態或 演化理論整合，也沒有以完善的生態或演化理論來測試。目前腸胃道微生物相的研究 通常是以分子技術從腸道或糞便中取得微生物多樣性（物種或OTU），接著進行親緣分 析，建立這些微生物的親緣關係樹。鮮少會進行生態分析，或是以生態理論來探討微 生物群落的變異。並且，這些研究只搜集物種清單（species list），缺乏相對豐度的量 化資料。 本研究欲調查台灣山區鼯鼠的腸胃道微生物相，並且以量化分析物種相對數量、多 源基因體序列與多源轉錄體序列資料。將針對生活在兩個分離區域（山區）的兩群鼯 鼠進行層級採樣（hierarchical sampling）。在每一群鼯鼠中各收集四隻，分別從鼯鼠的 大腸、小腸與結腸採集腸胃道微生物群聚（物種相對豐度）的資料。樣本將直接由活 體取出，而不從排泄物取得，如此能得到更精確的資料，更真實地反應微生物相完整 的動態，這是在人體實驗中做不到的。將以16 s rDNA為探針，估算消化道中微生物種 類的多樣性與相對豐度。採用多源基因體序列與多源轉錄體序列分析，讓我們從基因 功能的角度著手，直接分析微生物群落的功能組合，這是屬於創新性的嘗試，可以發 展出新的理論解釋生物群落的組成和穩定性。腸道菌群&#63768微生物生態統計生態學棲地&#63842質性&#63870質分子偵測Gastrointestinal microbial communitymicrobial ecological patternsstatistical ecology