獎項
1989-1991 Non-resident tuition and fee fellowship, UC Davis
1990 Travel Award for graduate student, UC Davis
1995,1999 Abbott New Categorical Research Award
1995,1997 Nestle Research Award
1996 魏火曜兒科優秀論文獎
1997 臺大醫院醫學研究特殊優異獎
1997 Pharmacia-Upjohn Research Award
1998 藤澤醫學研究獎助
1998 第三十六屆中華民國十大傑出青年
2001 莊淑綺女士傑出醫學研究獎
2002 跨世紀基金會研究獎助
2002 第十二屆王民寧醫藥研究傑出貢獻獎
2003,2007,2009,2013, 2017, 2018,2020 臺大教學優良教師
2004 北美校友會最佳臨床教師獎
2004, 2010, 2013 國科會及科技部傑出研究獎
2008-2010 國科會傑出學者研究計畫
2004 名儕吳天賜先生文教基金會傑出研究獎
2004 景福基金會研究貢獻獎(SARS研究團隊成員)
2005 臺灣保健食品學會傑出學術研究獎
2005 臺大醫院傑出研究獎
2008 第六屆有庠傑出教授獎
2009 臺灣醫學會學術演講獎
2012 第七屆李天德卓越醫藥科技獎
2012 臺大醫院傑出研究團隊
2014 臺大特聘教授
2016 第二十三屆東元獎
2016 第六十屆教育部學術獎
2018 第十六屆有庠科技講座
2019 李國鼎管理獎章
2020 衛道中學第一屆傑出校友