Dynamic incorporation of multiple in silico functional annotations empowers rare variant association analysis of large whole-genome sequencing studies at scale
Journal
Nature Genetics
Journal Volume
52
Journal Issue
9
Pages
969-983
Date Issued
2020
Author(s)
Li Z.
Zhou H.
Gaynor S.M.
Liu Y.
Chen H.
Sun R.
Dey R.
Arnett D.K.
Aslibekyan S.
Ballantyne C.M.
Bielak L.F.
Blangero J.
Boerwinkle E.
Bowden D.W.
Broome J.G.
Conomos M.P.
Correa A.
Cupples L.A.
Curran J.E.
Freedman B.I.
Guo X.
Hindy G.
Irvin M.R.
Kardia S.L.R.
Kathiresan S.
Khan A.T.
Kooperberg C.L.
Laurie C.C.
Liu X.S.
Mahaney M.C.
Manichaikul A.W.
Martin L.W.
Mathias R.A.
McGarvey S.T.
Mitchell B.D.
Montasser M.E.
Moore J.E.
Morrison A.C.
O’Connell J.R.
Palmer N.D.
Pampana A.
Peralta J.M.
Peyser P.A.
Psaty B.M.
Redline S.
Rice K.M.
Rich S.S.
Smith J.A.
Tiwari H.K.
Tsai M.Y.
Vasan R.S.
Wang F.F.
Weeks D.E.
Weng Z.
Wilson J.G.
Yanek L.R.
Abe N.
Abecasis G.R.
Aguet F.
Albert C.
Almasy L.
Alonso A.
Ament S.
Anderson P.
Anugu P.
Applebaum-Bowden D.
Ardlie K.
Arking D.
Arnett D.K.
Ashley-Koch A.
Aslibekyan S.
Assimes T.
Auer P.
Avramopoulos D.
Barnard J.
Barnes K.
Barr R.G.
Barron-Casella E.
Barwick L.
Beaty T.
Beck G.
Becker D.
Becker L.
Beer R.
Beitelshees A.
Benjamin E.
Benos T.
Bezerra M.
Bielak L.F.
Bis J.
Blackwell T.
Blangero J.
Boerwinkle E.
Bowden D.W.
Bowler R.
Brody J.
Broeckel U.
Broome J.G.
Bunting K.
Burchard E.
Bustamante C.
Buth E.
Cade B.
Cardwell J.
Carey V.
Carty C.
Casaburi R.
Casella J.
Castaldi P.
Chaffin M.
Chang C.
Chasman D.
Chavan S.
Chen B.-J.
Chen W.-M.
Chen Y.-D.I.
Cho M.
Choi S.H.
Chung M.
Chung R.-H.
Clish C.
Comhair S.
Conomos M.P.
Cornell E.
Correa A.
Crandall C.
Crapo J.
Cupples L.A.
Curran J.E.
Curtis J.
Custer B.
Damcott C.
Darbar D.
Das S.
David S.
Davis C.
Daya M.
de Andrade M.
Fuentes L.
DeBaun M.
Deka R.
DeMeo D.
Devine S.
Duan Q.
Duggirala R.
Durda J.P.
Dutcher S.
Eaton C.
Ekunwe L.
El Boueiz A.
Ellinor P.
Emery L.
Erzurum S.
Farber C.
Fingerlin T.
Flickinger M.
Fornage M.
Franceschini N.
Frazar C.
Fu M.
Fullerton S.M.
Fulton L.
Gabriel S.
Gan W.
Gao S.
Gao Y.
Gass M.
Gelb B.
Geng X.P.
Geraci M.
Germer S.
Gerszten R.
Ghosh A.
Gibbs R.
Gignoux C.
Gladwin M.
Glahn D.
Gogarten S.
Gong D.-W.
Goring H.
Graw S.
Grine D.
Gu C.C.
Guan Y.
Guo X.
Gupta N.
Haessler J.
Hall M.
Harris D.
Hawley N.L.
He J.
Heckbert S.
Hernandez R.
Herrington D.
Hersh C.
Hidalgo B.
Hixson J.
Hobbs B.
Hokanson J.
Hong E.
Hoth K.
Hsiung C.A.
Hung Y.-J.
Huston H.
Hwu C.M.
Irvin M.R.
Jackson R.
Jain D.
Jaquish C.
Jhun M.A.
Johnsen J.
Johnson A.
Johnson C.
Johnston R.
Jones K.
Kang H.M.
Kaplan R.
Kardia S.L.R.
Kathiresan S.
Kelly S.
Kenny E.
Kessler M.
Khan A.T.
Kim W.
Kinney G.
Konkle B.
Kooperberg C.L.
Kramer H.
Lange C.
Lange E.
Lange L.
Laurie C.C.
Laurie C.
LeBoff M.
Lee J.
Lee S.S.
Lee W.-J.
LeFaive J.
Levine D.
Levy D.
Lewis J.
Li X.
Li Y.
Lin H.
Lin H.
Lin K.H.
Lin X.
Liu S.
Liu Y.
Loos R.J.F.
Lubitz S.
Lunetta K.
Luo J.
Mahaney M.C.
Make B.
Manichaikul A.W.
Manson J.A.
Margolin L.
Martin L.W.
Mathai S.
Mathias R.A.
May S.
McArdle P.
McDonald M.-L.
McFarland S.
McGarvey S.T.
McGoldrick D.
McHugh C.
Mei H.
Mestroni L.
Meyers D.A.
Mikulla J.
Min N.
Minear M.
Minster R.L.
Mitchell B.D.
Moll M.
Montasser M.E.
Montgomery C.
Moscati A.
Musani S.
Mwasongwe S.
Mychaleckyj J.C.
Nadkarni G.
Naik R.
Naseri T.
Natarajan P.
Nekhai S.
Nelson S.C.
Neltner B.
Nickerson D.
North K.
O’Connell J.R.
O’Connor T.
Ochs-Balcom H.
Paik D.
Palmer N.D.
Pankow J.
Papanicolaou G.
Parsa A.
Peralta J.M.
Perez M.
Perry J.
Peters U.
Peyser P.A.
Phillips L.S.
Pollin T.
Post W.
Becker J.P.
Boorgula M.P.
Preuss M.
Psaty B.M.
Qasba P.
Qiao D.
Qin Z.
Rafaels N.
Raffield L.
Vasan R.S.
Rao D.C.
Rasmussen-Torvik L.
Ratan A.
Redline S.
Reed R.
Regan E.
Reiner A.
Reupena M.‘S.
Rice K.M.
Rich S.S.
Roden D.
Roselli C.
Rotter J.I.
Ruczinski I.
Russell P.
Ruuska S.
Ryan K.
Sabino E.C.
Saleheen D.
Salimi S.
Salzberg S.
Sandow K.
Sankaran V.G.
Scheller C.
Schmidt E.
Schwander K.
Schwartz D.
Sciurba F.
Seidman C.
Seidman J.
Sheehan V.
Sherman S.L.
Shetty A.
Shetty A.
Sheu W.H.-H.
Shoemaker M.B.
Silver B.
Silverman E.
Smith J.A.
Smith J.
Smith N.
Smith T.
Smoller S.
Snively B.
Snyder M.
Sofer T.
Sotoodehnia N.
Stilp A.M.
Storm G.
Streeten E.
Su J.L.
Sung Y.J.
Sylvia J.
Szpiro A.
Sztalryd C.
Taliun D.
Tang H.
Taub M.
Taylor K.D.
Taylor M.
Taylor S.
Telen M.
Thornton T.A.
Threlkeld M.
Tinker L.
Tirschwell D.
Tishkoff S.
Tiwari H.K.
Tong C.
Tracy R.
Tsai M.Y.
Vaidya D.
Van Den Berg D.
VandeHaar P.
Vrieze S.
Walker T.
Wallace R.
Walts A.
Wang F.F.
Wang H.
Watson K.
Weeks D.E.
Weir B.
Weiss S.
Weng L.-C.
Wessel J.
Willer C.J.
Williams K.
Williams L.K.
Wilson C.
Wilson J.G.
Wong Q.
Wu J.
Xu H.
Yanek L.R.
Yang I.
Yang R.
Zaghloul N.
Zekavat M.
Zhang Y.
Zhao S.X.
Zhao W.
Zhi D.
Zhou X.
Zhu X.
Zody M.
Zoellner S.
Abdalla M.
Abecasis G.R.
Assimes T.
Atkinson E.
Beitelshees A.
Bis J.
Bodea C.
Brody J.
Cade B.
Carlson J.
Chang I.-S.
Chen Y.-D.I.
Chun S.
Chung R.-H.
Damcott C.
de Vries P.
Do R.
Elliott A.
Fu M.
Ganna A.
Gong D.-W.
Graham S.
Haas M.
Haring B.
He J.
Heckbert S.
Himes B.
Hixson J.
Jain D.
Jarvik G.
Jhun M.A.
Jiang J.
Jun G.
Kalyani R.
Khera A.
Klarin D.
Kral B.
Lange L.
Laurie C.
Lemaitre R.
Li Z.
Li X.
Lin X.
Mathur R.
McHugh C.
McLenithan J.
Mikulla J.
Moran A.
Morrison A.C.
Nakao T.
Natarajan P.
Nickerson D.
North K.
O’Donnell C.
Pampana A.
Patel A.
Peloso G.M.
Perry J.
Peters U.
Pirruccello J.
Pollin T.
Preuss M.
Rao D.C.
Reed R.
Reiner A.
Rosenthal S.
Rotter J.I.
Schoenberg J.
Selvaraj M.S.
Sheu W.H.-H.
Sofer T.
Stilp A.M.
Sunyaev S.R.
Surakka I.
Sztalryd C.
Tang H.
Taylor K.D.
Uddin M.M.
Urbut S.
Verbanck M.
Von Holle A.
Wang H.
Wiggins K.
Willer C.J.
Wolford B.
Xu H.
Zaghloul N.
Zekavat M.
Zhang J.
Neale B.M.
Sunyaev S.R.
Peloso G.M.
NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) Consortium, TOPMed Lipids Working Group
SDGs
Other Subjects
high density lipoprotein cholesterol; low density lipoprotein cholesterol; spacer DNA; triacylglycerol; low density lipoprotein cholesterol; Article; biobank; cohort analysis; computer model; controlled study; epigenetics; gene disruption; gene replication; genetic association; genetic variability; human; large scale production; missense mutation; population structure; priority journal; single nucleotide polymorphism; whole genome sequencing; biological model; computer simulation; genetic predisposition; genetic variation; genetics; genome; genome-wide association study; molecular genetics; phenotype; procedures; whole genome sequencing; Cholesterol, LDL; Computer Simulation; Genetic Predisposition to Disease; Genetic Variation; Genome; Genome-Wide Association Study; Humans; Models, Genetic; Molecular Sequence Annotation; Phenotype; Whole Genome Sequencing
Publisher
Nature Research
Type
journal article